摘 要:研究以工業(yè)大麻“云麻7號(hào)”(Y7)為材料,克隆CsIAA1(Auxin-responsive protein IAA1)基因,通過(guò)生物信息學(xué)分析CsIAA1序列特征,經(jīng)RT-qPCR 研究CsIAA1組織特異性表達(dá)模式。結(jié)果表明,CsIAA1基因的CDS全長(zhǎng)為621 bp,編碼了206個(gè)氨基酸,含AUX_IAA保守結(jié)構(gòu)域,屬于不穩(wěn)定蛋白。系統(tǒng)進(jìn)化分析可知,工業(yè)大麻CsIAA1與糙葉山黃麻、東山麻等親緣關(guān)系較近。通過(guò)煙草葉片瞬時(shí)表達(dá)和共聚焦試驗(yàn)得知,CsIAA1基因定位在細(xì)胞核中。通過(guò)RT-qPCR分析發(fā)現(xiàn),在外源IAA處理12h內(nèi),CsIAA1在1h時(shí)快速響應(yīng)生長(zhǎng)素的處理,表達(dá)量最高。在工業(yè)大麻雄蕊不同發(fā)育階段中,發(fā)育初期表達(dá)量比發(fā)育期和盛花期要高,且隨著發(fā)育的進(jìn)行呈逐漸下降趨勢(shì),推測(cè)CsIAA1參與調(diào)控工業(yè)大麻雄蕊發(fā)育。該研究從工業(yè)大麻中克隆出生長(zhǎng)素響應(yīng)基因CsIAA1并對(duì)其進(jìn)行生信和表達(dá)分析,為后續(xù)探究工業(yè)大麻性別發(fā)育機(jī)制奠定了研究基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞:工業(yè)大麻;CsIAA1;氨基酸序列;保守結(jié)構(gòu)域;表達(dá)量
大麻(Cannabis sativa L.)為大麻科大麻屬一年生草本植物,主要用于生產(chǎn)纖維、大麻素、種子和油[1],而大麻素是大麻中特有的酚類(lèi)物質(zhì),目前發(fā)現(xiàn)大約有100種不同類(lèi)型[2]。自然界中,大麻為雌雄異株,雄花為復(fù)總狀花序,雌花為穗狀花序。雌花是積累大麻素的主要場(chǎng)所[3],會(huì)產(chǎn)生具有藥用價(jià)值的萜烯類(lèi)化合物,而雄株比雌株能生產(chǎn)更細(xì)的纖維[4]。
生長(zhǎng)素(IAA)是一種植物激素,能夠調(diào)節(jié)植物細(xì)胞的分裂、生長(zhǎng)和分化,以及根、莖、葉和果實(shí)的發(fā)育。植物可以迅速感知和響應(yīng)生長(zhǎng)素水平的變化,以調(diào)節(jié)自身的生長(zhǎng)和發(fā)育過(guò)程。而生長(zhǎng)素信號(hào)傳導(dǎo)途徑(SCFTIR1/AFBs-Aux/IAA)[5]主要通過(guò)負(fù)調(diào)控因子 Aux/IAAs(Auxin/Indole Acetic Acids)、生長(zhǎng)素受體 TIR1/AFBs(Transport Inhibitor Resistanti/Auxin Signaling F-boxs)以及生長(zhǎng)素激活或抑制因子ARFs之間的相互作用來(lái)完成。其中,Aux/IAA 蛋白含有 4 個(gè)高度保守的結(jié)構(gòu)域:結(jié)構(gòu)域I被確定為抑制結(jié)構(gòu)域,帶有乙烯反應(yīng)因子(ERF) 相關(guān)兩親抑制(EAR)基序“LxLxL”,可招募 TOPLESS(TPL)共抑制因子[6];結(jié)構(gòu)域 II是帶有保守基序“VGWPP”的降解單元,可與SCFTIR1(SKP-Cullin-F box)直接相互作用,影響蛋白的穩(wěn)定性[7];結(jié)構(gòu)域III包含一個(gè)βαα折疊,其與 Aux/IAA或ARF蛋白的同源和異源二聚化中起重要作用[8];結(jié)構(gòu)域III和IV可與生長(zhǎng)素響應(yīng)因子ARF相結(jié)合,這兩個(gè)結(jié)構(gòu)域與ARF的CTD結(jié)構(gòu)域具有相同的起源,能夠促使Aux/IAA蛋白自身形成二聚體、多聚體,并與ARF蛋白特異性結(jié)合,從而抑制生長(zhǎng)素響應(yīng)基因的表達(dá)[9]。
植物性別分化是植物在生長(zhǎng)過(guò)程中形成了性別上的差異[10]。生長(zhǎng)素能促進(jìn)植物雌性發(fā)育,這在獼猴桃(Actinidia arguta)[11]和黃瓜(Cucumis sativus)[10]研究中已報(bào)道,生長(zhǎng)素對(duì)雌花促進(jìn)作用可能是通過(guò)誘導(dǎo)乙烯合成來(lái)實(shí)現(xiàn)的。在大麻中,通過(guò)外源噴施生長(zhǎng)素可使得大麻雄株轉(zhuǎn)變?yōu)榇浦?/font>[12]。外源 IAA 可影響山靛(Mercurialis leiocarpa)雄性發(fā)育[13]。此外,高水平的生長(zhǎng)素與大麻雌化相關(guān),如大麻雌性花序中的生長(zhǎng)素含量高于雄性花序[14]。研究[10]表明,生長(zhǎng)素影響植物的性別分化是通過(guò)誘導(dǎo)植物器官發(fā)育相關(guān)調(diào)控基因的表達(dá)來(lái)實(shí)現(xiàn)。Aux/IAA 蛋白 AtIAA8 與 ARF6 和ARF8 之間存在互作關(guān)系,這種互作關(guān)系會(huì)影響下游生長(zhǎng)素誘導(dǎo)基因的表達(dá),從而調(diào)節(jié)擬南芥花器官的發(fā)育[15]。通過(guò)抑制 SI-IAA9 的表達(dá),可以導(dǎo)致番茄的萼片不對(duì)稱(chēng),從而影響葉、花和果實(shí)的形成[16]。擬南芥中,IAA8突變體會(huì)使得雌雄蕊發(fā)育異常[15]。iaa7/axr2-1在短日照下出現(xiàn)晚花,iaa16表現(xiàn)為花絲縮短,且iaa16純合體不育[17]。綜上所述,IAA基因在調(diào)節(jié)花器官的發(fā)育中起到了一定作用。
轉(zhuǎn)錄組包括特定組織或細(xì)胞在特定功能狀態(tài)下的所有轉(zhuǎn)錄本,能分析不同生長(zhǎng)階段和生理?xiàng)l件下的基因表達(dá)模式[18]。近年來(lái),已有諸多通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究進(jìn)而挖掘性別發(fā)育的關(guān)鍵基因。對(duì)砂梨雌雄花組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析發(fā)現(xiàn),乙烯相關(guān)基因表達(dá)量上調(diào),而赤霉素和脫落酸相關(guān)基因表達(dá)量下調(diào)[19]。對(duì)蘆筍的雌雄花進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析發(fā)現(xiàn),在蘆筍雌花和雄花上調(diào)表達(dá)的部分基因可能參與了花芽分化[20]。對(duì)柿的雌花芽和雄花芽進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析發(fā)現(xiàn),在雌雄花芽上調(diào)表達(dá)的基因中,有27個(gè)是與性別分化相關(guān)的基因[21]。對(duì)木薯雌花和雄花轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn),激素通路中生長(zhǎng)素基因表達(dá)下調(diào),推測(cè)其負(fù)調(diào)控木薯雌花發(fā)育[22]。對(duì)大麻雌雄花轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn),參與植物激素生物合成和信號(hào)傳導(dǎo)的基因與性別決定相關(guān)[23]。由此可知,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)為揭示植物性別分化機(jī)制奠定了良好基礎(chǔ)。
本研究利用課題組前期獲得的工業(yè)大麻品種“云麻 7 號(hào)”雌雄蕊轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,篩選出在雄蕊發(fā)育階段具有顯著性差異表達(dá)的CsIAA1基因(∣Log2FC∣≥1, P<0.05),并對(duì)CsIAA1基因進(jìn)行了克隆及生信分析,對(duì)其在大麻不同組織、不同處理后的表達(dá)量進(jìn)行研究,旨為CsIAA1在工業(yè)大麻雄蕊發(fā)育過(guò)程中的作用機(jī)制提供理論依據(jù)。
1材料方法
1.1 植物材料
工業(yè)大麻雌雄異株品種“云麻 7 號(hào)”簡(jiǎn)稱(chēng)Y7,是由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院麻類(lèi)研究所提供。選取籽粒飽滿(mǎn)的種子于室溫超純水浸泡一晚,均勻播在含有濕潤(rùn)紙巾的發(fā)芽盒里,于恒溫培養(yǎng)箱(26℃,光照16h,黑暗8h)進(jìn)行催芽。一周后,選取長(zhǎng)勢(shì)一致的大麻幼苗播種在裝有育苗基質(zhì)的培養(yǎng)盆中,置于人工氣候室培養(yǎng)。
1.2 CsIAA1基因克隆
從工業(yè)大麻 Y7 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中篩選出 CsIAA1(Auxin-responsive protein IAA1)基因,參照工業(yè)大麻基因組上該基因的ORF區(qū)(LOC115719320)序列信息,利用 Primer5軟件設(shè)計(jì)基因克隆引物 CsIAA1-F/R(表5),并由北京擎科生物科技有限公司合成。使用SteadyPure植物RNA提取試劑盒(艾科瑞生物科技有限公司,長(zhǎng)沙)提取工業(yè)大麻Y7雄蕊的總RNA,用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)提取的總RNA的純度及濃度。然后,使用賽默飛生物科技有限公司的Thermo Scientific RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit 反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA,具體步驟如見(jiàn)說(shuō)明書(shū)。使用TOYOBO Bio公司的 TOYOBO KOD FX DNA Polymerase 試劑進(jìn)行目的基因CDS區(qū)的擴(kuò)增,反應(yīng)程序?yàn)椋侯A(yù)變性94℃ 2 min,變性98℃ 10 s,退火55℃ 30 s,延伸68℃ 2 min,35個(gè)循環(huán),最后72℃延伸10 min,于4℃保存。
目的基因PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳分離后,使用美國(guó)Omega生物公司的OmegaD2500-01膠回收試劑盒進(jìn)行膠回收。使用全式金生物科技有限公司的 pEASY-Blunt Cloning Vector克隆載體將回收產(chǎn)物通過(guò)平末端的方式和克隆載體相連,連接體系及程序見(jiàn)說(shuō)明書(shū)。然后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞(全式金生物科技有限公司,北京)中,隨后涂布在含有1/1000終體積Amp(50mg/mL)抗生素的LB固體培養(yǎng)基上,37℃倒置培養(yǎng)一晚。待平板上長(zhǎng)出單一的菌落,挑取單克隆于10 µL滅菌超純水中吸打混勻。取2 µL為模板, 以Taq DNA聚合酶(全式金科技生物有限公司)做菌液PCR檢測(cè)(表1)。檢測(cè)為陽(yáng)性克隆送至北京擎科生物科技有限公司進(jìn)行測(cè)序。
表1 PCR 反應(yīng)體系及程序
1.3 CsIAA1 基因生物信息學(xué)分析
使用CsIAA1的CDS序列及其翻譯蛋白進(jìn)行以下生物信息學(xué)分析(表2)。
表2 生物信息學(xué)分析網(wǎng)站
1.4 亞細(xì)胞定位分析
使用的植物雙元表達(dá)載體PBI121-GFP購(gòu)自北京天恩澤基因科技有限公司。選取BamHⅠ為限制性酶切位點(diǎn)。利用同源重組方法構(gòu)建PBI121-CsIAA-GFP。PBI121-CsIAA-GFP農(nóng)桿菌(GV3101)過(guò)夜培養(yǎng)至OD=0.6,4000 r/min離心20 min 收集菌體,將菌體重懸至侵染液(10 mmol/L MgCl2、10 mmol/L MES、150μmol/L 乙酰丁香酮,pH=5.6)中,室溫靜置3h后,用1 mL的針頭注射煙草葉片(煙草培養(yǎng)條件為:16 h光照/8h黑暗,溫度25℃,相對(duì)濕度70%,培養(yǎng)大概4~5周),48h后制片觀察。
1.5 CsIAA1 表達(dá)模式分析
選擇 UBQ5 作為內(nèi)參基因,qRT-PCR 引物使用 Primer3 在線(xiàn)網(wǎng)站進(jìn)行設(shè)計(jì),序列如表3所示。使用艾科瑞生物科技有限公司的 SteadyPure 植物RNA提取試劑盒提取工業(yè)大麻不同組織和不同處理下的RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA后,使用艾科瑞生物科技有限公司 SYBR Green Premix Pro Taq HS qPCR Kit 進(jìn)行qPCR 擴(kuò)增,具體操作步驟見(jiàn)說(shuō)明書(shū)。每個(gè)樣品設(shè)計(jì)3個(gè)生物學(xué)重復(fù),每個(gè)生物學(xué)重復(fù)設(shè)計(jì)3個(gè)技術(shù)重復(fù),采用 2-ΔΔCT 進(jìn)行基因表達(dá)水平的計(jì)算,采用 GraphPad Prism 8軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理。
表3 引物序列
2結(jié)果與分析
2.1 工業(yè)大麻CsIAA1基因克隆
以工業(yè)大麻Y7雄蕊的cDNA為模板,使用CsIAA1-F/R進(jìn)行目的片段的克隆。結(jié)果顯示,測(cè)序片段與目的基因片段序列比對(duì)結(jié)果一致,表明克隆成功(圖1)。
圖1 CsIAA1基因克隆
2.2 工業(yè)大麻 CsIAA1 生物信息學(xué)分析
2.2.1 CsIAA1 基因結(jié)構(gòu)域分析
對(duì)CsIAA1基因進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),該基因CDS區(qū)全長(zhǎng)為621bp,編碼206個(gè)氨基酸。利用NCBI中CD-search對(duì)CsIAA1蛋白的功能結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果表明,該蛋白含有一個(gè)植物特有的AUX_IAA保守結(jié)構(gòu)域(圖2),提示其屬于Aux/IAA基因家族。
圖2 CsIAA1保守結(jié)構(gòu)域
2.2.2 CsIAA1基因理化性質(zhì)分析
CsIAA1的分子式為C1006H1578N272O328S13,原子總數(shù)3197個(gè),分子量為23148.00,理論等電點(diǎn)為5.30。CsIAA1蛋白是由206個(gè)氨基酸組成的,其中絲氨酸Ser(9.7%)、谷氨酸Gln(9.2%)、賴(lài)氨酸Lys(8.7%)含量最多。蛋白質(zhì)不穩(wěn)定系數(shù)為42.10%,為不穩(wěn)定性蛋白。該蛋白平均親水性為-0.766,為親水性蛋白(圖3)。
圖3 CsIAA1蛋白親疏水性分析
2.2.3 CsIAA1蛋白一級(jí)結(jié)構(gòu)分析
通過(guò)對(duì)CsIAA1信號(hào)肽和跨膜區(qū)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn),CsIAA1中不存在信號(hào)肽和跨膜區(qū)(圖4)。通過(guò)Netphos3.1Server在線(xiàn)網(wǎng)站對(duì)CsIAA1蛋白進(jìn)行預(yù)測(cè),CsIAA1蛋白有23個(gè)磷酸化位點(diǎn)(Ser位點(diǎn)為13個(gè),Thr位點(diǎn)為7個(gè),Tyr位點(diǎn)為3個(gè)),其中,蛋白Se磷酸化位點(diǎn)最多,CsIAA1的磷酸化可能主要發(fā)生在絲氨酸殘基上。
圖4 CsIAA1蛋白跨膜區(qū)預(yù)測(cè)
2.2.4 CsIAA1蛋白二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)分析
通過(guò)對(duì)CsIAA1蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn),CsIAA1蛋白是由α螺旋結(jié)構(gòu)(26.21%)、延伸鏈結(jié)構(gòu)(17.96%)、β轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)(4.37%)和無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)(51.46%)組成(圖5),三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果相一致(圖6)。
圖5 CsIAA1蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
圖6 CsIAA1基因編碼蛋白產(chǎn)物的三級(jí)結(jié)構(gòu)
2.2.5 CsIAA1基因系統(tǒng)發(fā)育分析
使用NCBI-blastp對(duì)蛋白序列進(jìn)行同源性分析發(fā)現(xiàn),工業(yè)大麻CsIAA1與糙葉山黃麻PaIAA1、東山麻T(mén)oIAA1及青葉苧麻BnIAA1等的序列相似性為86.73%(圖7)。
圖7 工業(yè)大麻IAA1 蛋白與其他植物IAA1蛋白的氨基酸序列同源比對(duì)
使用MEGA7.0構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),發(fā)現(xiàn)工業(yè)大麻CsIAA1與糙葉山黃麻PaIAA1、東山麻T(mén)oIAA1等親緣關(guān)系較近(圖8)。
圖8 進(jìn)化樹(shù)分析
2.3亞細(xì)胞定位分析
利用含PBI121-CsIAA1-GFP農(nóng)桿菌對(duì)煙草葉片進(jìn)行了瞬時(shí)轉(zhuǎn)化,共聚焦顯微鏡檢測(cè)結(jié)果如圖11所示,PBI121-GFP空載對(duì)照在所有細(xì)胞器中都能發(fā)出綠色熒光,而PBI121-CsIAA1-GFP在細(xì)胞核中發(fā)出綠色熒光,表明CsIAA1基因定位在細(xì)胞核中(圖9)。
圖9 CsIAA1亞細(xì)胞定位
2.4 CsIAA1在工業(yè)大麻Y7雄蕊不同發(fā)育階段的表達(dá)分析
以不同發(fā)育階段雄蕊大小劃分為盛花期(直徑2.398 mm、長(zhǎng)度3.547 mm,接近開(kāi)花散粉階段)、發(fā)育期(直徑1.897 mm、長(zhǎng)度2.892 mm)和發(fā)育初期(直徑1.098 mm、長(zhǎng)度1.528 mm)[24]。發(fā)現(xiàn) CsIAA1 在其他組織中的表達(dá)量遠(yuǎn)高于在雄蕊中的表達(dá)量,在雄蕊發(fā)育初期的表達(dá)量比發(fā)育期和盛花期高。CsIAA1基因隨著工業(yè)大麻雄蕊的發(fā)育,其表達(dá)量逐漸降低(圖10)。
圖10 雄蕊不同發(fā)育階段基因表達(dá)分析
2.5 CsIAA1對(duì)外源生長(zhǎng)素處理的表達(dá)分析
為了觀察生長(zhǎng)素對(duì)CsIAA1基因的表達(dá)是否有影響,使用 20μmol/L外源 IAA噴施六葉期工業(yè)大麻雄株,當(dāng)葉面濕潤(rùn)并有液體下滴時(shí)停止噴施,于 0、0.5、1、6、12h 取處理葉片。結(jié)果如圖11所示,在IAA處理1h后,CsIAA1基因表達(dá)量最高,隨后降低。以上結(jié)果表明,CsIAA1基因能夠快速響應(yīng)IAA,且是在1h內(nèi)快速響應(yīng)的。
圖11 IAA處理后CsIAA1基因的相對(duì)表達(dá)量
3討論
生長(zhǎng)素在植物生長(zhǎng)發(fā)育中扮演著重要的角色,是許多植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中的關(guān)鍵信號(hào)分子,通過(guò)調(diào)控基因表達(dá)來(lái)影響植物的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程[25]。植物原初響應(yīng)基因是一類(lèi)可以被生長(zhǎng)素誘導(dǎo)表達(dá)的特異性基因家族,包括Aux/IAA、GH3 和 SAUR 三大類(lèi)。Aux/IAA 基因在調(diào)控生長(zhǎng)素信號(hào)傳導(dǎo)途徑中扮演著重要的角色,它們以基因家族的形式存在于許多植物中[26]。在本研究中,從工業(yè)大麻中克隆了一個(gè)與雄蕊發(fā)育相關(guān)的 Aux/IAA 家族基因拷貝,其cDNA序列的CDS全長(zhǎng)為621 bp,編碼了206個(gè)氨基酸,屬于不穩(wěn)定蛋白質(zhì)。據(jù)報(bào)道,小麥(Triticum aestivum)中有84個(gè)Aux/IAA成員[27],玉米(Zea mays)中有40個(gè)[28],水稻(Oryza sativa) 中有31個(gè)[29],擬南芥(Arabidopsis thaliana)中有29個(gè)[30],龍眼(Dimocarpus longan)有18個(gè)[31],番茄(Lycopersicon esculentum)[32]、高粱(Sorghum bicolor)[33]和葡萄(Vitis vinifera)[34]等多種植物中有25個(gè),陸地棉(Gossypium hirsutum)中有10個(gè)[35],桑樹(shù)(Morus alba)有 51個(gè)MnAux/IAA基因家族成員[36],這表明高等植物中存在多樣化現(xiàn)象。結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果顯示,CsIAA1屬于 Aux/IAA超家族成員。
CsIAA蛋白中含有Domain III,推測(cè)該蛋白可能通過(guò)這個(gè)結(jié)構(gòu)域中βαα-fold與其他Aux/IAA 或ARF蛋白形成同源二聚體和異源二聚體[37]。Dl-IAA基因在龍眼花的芽分化過(guò)程中發(fā)揮作用,并且Dl-IAA2和Dl-IAA17可能在促進(jìn)開(kāi)花過(guò)程中發(fā)揮作用[31]。研究表明,AtIAA8與AtARF6和AtARF8互作,影響下游生長(zhǎng)素誘導(dǎo)基因的表達(dá),進(jìn)而表明Aux/IAA參與調(diào)節(jié)花器官的發(fā)育[15]。在番茄中,SI-IAA9蛋白能夠影響花器官的發(fā)育[17],敲除 SI-IAA27會(huì)顯著降低胚珠和花粉的育性[38]。由此可見(jiàn),Aux/IAA 基因可以影響植物的性別分化。
在本研究中,經(jīng)過(guò)亞細(xì)胞定位得出,CsIAA1基因在細(xì)胞核中發(fā)出綠色熒光,推測(cè)其在細(xì)胞核中表達(dá)。經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析,工業(yè)大麻CsIAA1與糙葉山黃麻、東山麻等親緣關(guān)系較近。通過(guò)使用 20μmol/L 的外源IAA處理發(fā)現(xiàn),在IAA處理12h內(nèi),CsIAA1在0.5 h時(shí)快速響應(yīng)生長(zhǎng)素的處理,其表達(dá)量最高,說(shuō)明IAA 具有促進(jìn)Aux/IAA基因表達(dá)的作用。而在核桃中,外源噴施生長(zhǎng)素,12個(gè)IAA基因下調(diào)[39]。在雄蕊不同發(fā)育階段中,CsIAA1 在雄蕊發(fā)育初期的表達(dá)量比發(fā)育期和盛花期高,且隨著發(fā)育呈現(xiàn)出逐漸下降的趨勢(shì)。因此,推測(cè)CsIAA1基因參與調(diào)控工業(yè)大麻雄蕊發(fā)育。
4結(jié)論
本研究從工業(yè)大麻 Y7中克隆出CsIAA1基因。生信分析表明,CsIAA1蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)以無(wú)規(guī)則卷曲為主,占51.46%,其次是α-螺旋,占26.21%,還有17.96%的延伸鏈和4.37%的β-轉(zhuǎn)角。該蛋白具有不穩(wěn)定性、親水性、不跨膜、不含信號(hào)肽的特點(diǎn)。經(jīng)亞細(xì)胞定位分析,其定位在細(xì)胞核中。qPCR 結(jié)果顯示,隨著雄蕊的發(fā)育,CsIAA1表達(dá)量逐漸降低,提示其可能參與工業(yè)大麻雄蕊發(fā)育的調(diào)控。以上結(jié)果為進(jìn)一步研究Aux/IAA基因家族在雄蕊發(fā)育中的功能提供了參考。
參考文獻(xiàn):
[1]Salentijn M E,Zhang Q Y,Amaducci S,et al.New developments in fiber hemp (Cannabis sativa L.) breeding[J].Industrial Crops & Products, 2015,68:32-41.
[2]M C A,Jean-Francois H,Gea G.Cannabis sativa:The plant of the thousand and one molecules[J].Frontiers in plant science,2016,7:19.
[3]Harm B V,M J S,G A C,et al.The draft genome and transcriptome of Cannabis sativa[J].Genome biology,2011,12(10):R102.
[4]Amaducci S,Scordia D,LIU F H,et al.Key cul tivation techniques for hemp in Europe and China[J].Industrial Crops & Products,2015,68: 2-16.
[5]Salehin M,Bagchi R,Estelle M.SCFTIR1/AFB-based auxin perception: mechanism and role in plant growth and development[J].The Plant Cell, 2015,27(1):9-19.
[6]Szemenyei H,Hannon M,Long J A.TOPLESS mediates auxin-dependent transcriptional repressionduring Arabidopsis embryogenesis[J]. Science,2008,319(5868):1384-1386.
[7]Kepinski S,Leyser O.The Arabidopsis F-box protein TIR1 is an auxin receptor[J].Nature,2005,435(7041):446-451.
[8]Hagen G,Guilfoyle T.Auxin-responsive gene expression:Genes, promoters and regulatory factors[J].Plant molecular biology.2002, 49(3-4):373-385.
[9]Woodward A W,Bonnie B.Auxin:regulation,action,and interaction[J]. Annals of botany,2005,95(5):707-35.
[10]陳學(xué)好,曾廣文,曹碚生.黃瓜花性別分化和內(nèi)源激素的關(guān)系[J].植物生理學(xué)通訊,2002,38(4):317-320.
[11]李曉艷,王振興,秦紅艷,等.軟棗獼猴桃雌雄株花蕾發(fā)育過(guò)程中內(nèi)源激素的動(dòng)態(tài)變化[J].吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2016,38(3):281-286.
[12]劉麗杰,孫玉婷,丁美云,等.植物激素IAA和6-BA對(duì)漢麻生理代謝及性別分化的影響[J].分子植物育種,2023:1-8.
[13]邵宏波,初立業(yè),姜恩來(lái).高等植物性別研究的新進(jìn)展[J].世界科學(xué), 1993(5):26-28.
[14]景文昭.生長(zhǎng)素和蔗糖調(diào)控文冠果不同位置雌蕊發(fā)育的機(jī)理研究[D].北京: 北京林業(yè)大學(xué),2020.
[15]王婧.擬南芥Aux/IAA家族基因IAA8參與花器官發(fā)育的研究[D].湖北:武漢大學(xué),2012.
[16]ZHANG J H,CHEN R G,XIAO J H,et al.A single-base deletion mutationin SI-IAA9 gene causes tomato (Solanum lycopersicum) entire mutant[J]. Plant Research,2007,120(6):671-678.
[17]RINALDI M A,LIU J,ENDERS T A,et al.A gain-of-function mutation in IAA16 confers reduced responses to auxin and abscisic acid and impedes plant growth and fertility[J].Plant Molecular Biology,2012,79(4-5): 359-373.
[18]閆春冬.南瓜性別分化轉(zhuǎn)錄組及差異表達(dá)基因分析[D].哈爾濱:東北農(nóng)業(yè)大學(xué),2018.
[19]SONGLING B,TAKANORI S,DAISUKE S,et al.Tanalysis of Japanese pear (Pyrus pyrifolia Nakai) flower buds transitioning through endodormancy[J].
[20]GAO W,LI S,ZHANG G,et al.Comparative analysis of gene expression by microarray analysis of male and female flowers of asparagus officinalis[J].Biosci Biotechnol Biochem,2013,77(6):1193-1199.
[21]杜改改.柿花性別分化調(diào)控的關(guān)鍵基因篩選及表達(dá)模式分析[D].北京:中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院,2017.
[22]陳會(huì)鮮,梁振華,黃珍玲,等.木薯花性別分化關(guān)鍵時(shí)期的轉(zhuǎn)錄組分析及雌花分化相關(guān)候選基因的篩選[J].作物學(xué)報(bào),2023,49(12):3250-3260.
[23]Adal AM,Doshi K,Holbrook L,et al.Comparative RNA-Seq analysis reveals genes associated with masculinization in female Cannabis sativa[J].Planta,2021,253(1):17.
[24]陶杰.工業(yè)大麻雄性連鎖InDel標(biāo)記的篩選及雄性發(fā)育機(jī)制的探究[D].北京:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院,2022.
[25]李艷林,高志紅,宋娟.植物生長(zhǎng)素響應(yīng)因子ARF與生長(zhǎng)發(fā)育[J].植物生理學(xué)報(bào),2017,53(10):1842-1858.
[26]Ljung K.Auxtin metabolism and homeostasis during plant development[J].Development,2013,140(5):943-950.
[27]Bhumica S,Archana C,Jitendra P K,et al.An early auxin-responsive Aux/IAA gene from wheat (Triticum aestivum) is induced by epibrassinolide and differentially regulated by light and calcium[J]. Journal of experimental botany,2006,57(15):4059-4070.
[28]WANG Y J,DENG D X,BIAN Y L,et al.Genome-wide analysis of primary auxin-responsive Aux/IAA gene family in maize (Zea mays L.)[J]. Molecular biology reports,2010,37(8):3991-4001.
[29]李司敏.水稻 Aux/IAA 基因家族進(jìn)化分析及 OsIAA23基因功能的鑒定[D]. 南京:南京大學(xué),2019.
[30]Dreher K A,Browen J,SAW R E,et al.The Arabidopsis Aux/IAA protein family has diversified in degradation and auxin responsiveness[J]. The Plant Cell,2006,18(3):699-714.
[31]梁釩,張藝勇,張夢(mèng)媛,等.龍眼 Aux/IAA 基因家族全基因組鑒定及表達(dá)分析[J].果樹(shù)學(xué)報(bào),2021,38(11):1839-1853.
[32]SU L H,XIE Y D,HE Z Q,et al.Network response of two cherry tomato (Lycopersicon esculentum) cultivars to Cadmium stress as revealed by transcriptome analysis[J].Ecotoxicology and Environmental Safety, 2021,222:112473.
[33]Jain M,Kaur N,Garg R,et al.Structure and expression analysis of early auxin-responsive Aux/IAA gene family in rice(Oryza sativa)[J].Funct Integr Ge-nomics,2006,6(1):47-59.
[34]袁華招,趙密珍,吳偉民,等.葡萄生長(zhǎng)素響應(yīng)基因家族生物信息學(xué)鑒定和表達(dá)分析[J].遺傳,2015,37(7):720-730.
[35]HAN X,XU X,FANG D D,et al.Cloning and expression analysis of novel Aux/IAA family genes in Gossypium hirsutum[J].Gene,2012,503(1): 83-91.
[36]馮曦,豆浩,孫佳佳,等.桑樹(shù) Aux/IAA 基因家族鑒定與 IBA處理下表達(dá)模式分析[J].河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2023,1-16.
[37]Gretchen H,Tom G.Auxin-responsive gene expression:genes,promoters and regulatory factors[J].Plant molecular biology,2002,49(3-4): 373-85.
[38]Bassa C,Mila I,Bouzayen Met,al.Phenotypes associated with down-regulation of SI-IAA27 support functional diversity among Aux/IAA family members in tomato[J].Plant Cell Physiol,2012,53(9): 1583-1595.
[39]李義霞,魚(yú)尚奇,郭眾仲,等.外源IAA 對(duì)核桃內(nèi)果皮生長(zhǎng)發(fā)育的影響[J]. 果樹(shù)學(xué)報(bào),2024,41(05):941-955.
文章摘自:楊曉娟,陽(yáng)錫濤,蘇雨娟,等.工業(yè)大麻CsIAA1基因克隆及表達(dá)分析[J/OL].中國(guó)麻業(yè)科學(xué),1-14[2024-08-03].http://kns.cnki.net/kcms/detail/43.1467.S.20240719.1106.006.html.
