摘 要:工業(yè)大麻的生長(zhǎng)和發(fā)育情況對(duì)藥用成分的含量、纖維品質(zhì)和產(chǎn)量均有較大的影響。隨著數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析方法、數(shù)量遺傳學(xué)、分子生物學(xué)和生物信息學(xué)的飛速發(fā)展,分子標(biāo)記技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用到工業(yè)大麻的生長(zhǎng)發(fā)育研究中,可以在分子水平上明確不同品種的遺傳背景、變異規(guī)律、代謝網(wǎng)絡(luò)調(diào)控因素等,從而加快對(duì)工業(yè)大麻各種性狀的研究進(jìn)程。本研究全面介紹了分子標(biāo)記技術(shù)在工業(yè)大麻研究中的應(yīng)用現(xiàn)狀、全基因組關(guān)聯(lián)分析、特異性標(biāo)記的開(kāi)發(fā)等研究工作,簡(jiǎn)要講述了分子標(biāo)記輔助選擇的優(yōu)越性,探討了分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展方向和潛力,為工業(yè)大麻種質(zhì)資源創(chuàng)新奠定基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞:工業(yè)大麻;分子標(biāo)記;全基因組關(guān)聯(lián)分析;特異性標(biāo)記
大麻(Cannabis sativa L.)是大麻屬一年生直立草本植物,雌雄異株,按THC的含量分為藥用型、中間型和纖維型(工業(yè)大麻),具有較高的藥用價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。工業(yè)大麻中所含有的CBD具有抗炎、殺菌、鎮(zhèn)痛、減輕精神疾病、抗氧化等功效,可用于治療焦慮和睡眠障礙、止痛消炎、神經(jīng)保護(hù)、抗腫瘤和保護(hù)血管等方面疾病(寧康等,2020);除此以外,工業(yè)大麻的纖維是各種植物纖維中最細(xì)軟的一種,其獨(dú)特的結(jié)構(gòu)具有吸濕排汗、阻擋紫外線輻射、避免靜電、耐熱、抗霉殺菌等功能;工業(yè)大麻籽油富含不飽和脂肪酸和植物甾醇,可以降低膽固醇、抗氧化、清除人體內(nèi)自由基等功效,屬于高利用價(jià)值的功能性油脂(盧延旭等,2007)。
工業(yè)大麻的農(nóng)藝性狀(即纖維含量,植株性別等)、品種類型均為目前工業(yè)大麻育種和法醫(yī)學(xué)研究的主要方向,為了研究結(jié)果更加精準(zhǔn)、快速,隨著多元數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析方法、數(shù)量遺傳學(xué)、分子生物學(xué)和生物信息學(xué)的飛速發(fā)展,分子標(biāo)記技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用到工業(yè)大麻研究中,并且不斷更新?lián)Q代保障研究更加深入。迄今為止,研究方向主要有品種類型鑒定、遺傳多樣性分析、性別鑒定、種質(zhì)資源鑒定、全基因組關(guān)聯(lián)分析(genome-wide association studies, GWAS)以及特異性標(biāo)記開(kāi)發(fā)等,本綜述將對(duì)分子標(biāo)記技術(shù)在工業(yè)大麻研究中的應(yīng)用和發(fā)展前景進(jìn)行介紹。
1分子標(biāo)記技術(shù)在工業(yè)大麻中的應(yīng)用進(jìn)展
分子標(biāo)記技術(shù)種類繁多,在工業(yè)大麻研究中的應(yīng)用主要有以下幾種:限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性標(biāo)記技術(shù)(restriction fragment length polymorphism,RFLP),隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA標(biāo)記技術(shù)(randomly amplified polymorphic DNA,RAPD )和序列特征化擴(kuò)增區(qū)域標(biāo)記技術(shù)(sequence characterized amplified region,SCAR),簡(jiǎn)單重復(fù)序列標(biāo)記技術(shù)(simple sequence repeat, SSR)、短串聯(lián)重復(fù)標(biāo)記技術(shù)(short tandem repeats,STR)和簡(jiǎn)單重復(fù)序列間區(qū)標(biāo)記技術(shù)(inter-simple sequence repeat,ISSR),以及擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性標(biāo)記技術(shù)(amplified fragment length polymorphism,AFLP)。
1.1RFLP分子標(biāo)記
RFLP是第一個(gè)被應(yīng)用于遺傳研究的DNA分子標(biāo)記,其原理是利用限制性內(nèi)切酶酶解后,得到差異性片段與發(fā)生形態(tài)分離的數(shù)據(jù)相結(jié)合,進(jìn)而構(gòu)建遺傳連鎖圖譜,使間接選擇簡(jiǎn)單易行。RFLP標(biāo)記在生物體內(nèi)廣泛存在,且數(shù)目無(wú)限可覆蓋整個(gè)基因組、結(jié)果穩(wěn)定可靠。RFLP主要應(yīng)用于構(gòu)建遺傳圖譜、基因定位、遺傳多樣性和物種親緣關(guān)系鑒定、種質(zhì)鑒定和遺傳背景分析,在工業(yè)大麻的研究中重要用來(lái)進(jìn)行藥用型品種的鑒定。
Cirovic等(2017)使用RFLP方法,對(duì)20種藥用大麻樣品和3種工業(yè)大麻樣品進(jìn)行了THCA(tetrahydrocannabinolic acid)合成酶基因活性的分析,發(fā)現(xiàn)藥用大麻樣品均為活性拷貝,其中16種為雜合子,工業(yè)大麻品種均為純合的非活性拷貝,據(jù)此建立了一個(gè)快速而準(zhǔn)確的大麻樣品法醫(yī)學(xué)分析算法,可解答分析樣品是否能夠產(chǎn)生濃度高于0.3%的THC (Δ-9-tetrahidrocanabinol)的問(wèn)題。但在RFLP的操作過(guò)程中,對(duì)樣品DNA質(zhì)量要求較高,且須使用放射性同位素進(jìn)行分子雜交、酶切等,步驟較為繁瑣。
1.2RAPD和SCAR分子標(biāo)記
RAPD標(biāo)記技術(shù)是通過(guò)分析遺傳物質(zhì)DNA經(jīng)過(guò)PCR擴(kuò)增的多態(tài)性來(lái)確定生物體內(nèi)在基因排布與外在性狀表現(xiàn)規(guī)律的技術(shù)。在植物學(xué)研究中,RAPD標(biāo)記技術(shù)主要應(yīng)用于遺傳資源保存和分類、遺傳多樣性研究、遺傳圖譜構(gòu)建、種質(zhì)資源鑒定、品種純度鑒定和雜交育種、突變檢測(cè)、基因標(biāo)記和基因組比較等。其所用引物無(wú)種屬限制、不需要探針,操作簡(jiǎn)便。RAPD標(biāo)記技術(shù)在大麻研究中較多的應(yīng)用于種質(zhì)資源遺傳多樣性、品種鑒定和產(chǎn)地溯源、遺傳變異分析、性別鑒定和SCAR標(biāo)記開(kāi)發(fā)等方面。
湯志成等(2013)通過(guò)RAPD技術(shù)對(duì)12份野生型和4份栽培品種進(jìn)行遺傳多樣性研究,將16份種質(zhì)資源分成3個(gè)類群,與表型聚類結(jié)果相同;篩選出14條引物可以擴(kuò)增出79條多態(tài)性條帶,表明我國(guó)野生大麻遺傳變異較復(fù)雜。陳璇等(2015)對(duì)云南5個(gè)工業(yè)大麻品種進(jìn)行RAPD和ISSR分子標(biāo)記鑒定,共得到多態(tài)性位點(diǎn)64個(gè),品種間遺傳相似系數(shù)為0.8749-0.9255,即5個(gè)品種間遺傳多樣性較小,可為育種群體的選擇提供依據(jù)。黃艷梅等(2013)對(duì)國(guó)內(nèi)4省6地100株工業(yè)大麻樣品進(jìn)行RAPD和ISSR引物擴(kuò)增,所得到的多態(tài)性條帶所占比率分別為51.9%和57.9%,結(jié)果可用來(lái)鑒定大麻種類和產(chǎn)地溯源。姜穎等(2017)對(duì)經(jīng)過(guò)化學(xué)誘變和物理誘變的工業(yè)大麻材料進(jìn)行遺傳變異分析,結(jié)果顯示Co60-γ誘變劑量在100-150 Gy之間、2% EMS誘變劑處理6 h的條件下后代發(fā)生突變幾率較高。
由于RAPD標(biāo)記技術(shù)利用單條引物擴(kuò)增多個(gè)基因位點(diǎn)導(dǎo)致結(jié)果不穩(wěn)定,可將具有多態(tài)性的RAPD擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行克隆和測(cè)序,設(shè)計(jì)一對(duì)稍長(zhǎng)且互補(bǔ)的的引物將RAPD標(biāo)記轉(zhuǎn)化為更穩(wěn)定的SCAR標(biāo)記。陳其軍等(2001)用30個(gè)RAPD引物對(duì)10株工業(yè)大麻雌株和10株雄株進(jìn)行分析,最后篩選出1個(gè)與性別相關(guān)的特異性引物,并通過(guò)片段克隆和序列分析將其轉(zhuǎn)化為SCAR標(biāo)記。李仕金等(2012)選用200條RAPD引物在云麻1號(hào)中擴(kuò)增出一條大麻雄性相關(guān)的特異性條帶,并將該條RAPD引物轉(zhuǎn)換成SCAR標(biāo)記。趙銘森等(2019)通過(guò)3個(gè)已有的工業(yè)大麻雄性相關(guān)標(biāo)記開(kāi)發(fā)出6個(gè)SCAR標(biāo)記,其中1個(gè)標(biāo)記MADC2-8在123份已知性別的工業(yè)大麻樣本材料群體中進(jìn)行驗(yàn)證,準(zhǔn)確性達(dá)98.34%。姜穎等(2019)通過(guò)RAPD分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)一個(gè)工業(yè)大麻品種的雌雄株進(jìn)行引物篩選,獲得1條與雄性相關(guān)的特異性條帶,以此設(shè)計(jì)2個(gè)SCAR標(biāo)記引物,可對(duì)苗期性別未知的植株進(jìn)行預(yù)測(cè)應(yīng)用。趙艷紅等(2021)在560對(duì)相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性(Sequence-related amplified polymorphism, SRAP)標(biāo)記引物中篩選出24對(duì)雌雄差異相關(guān)引物,其中發(fā)現(xiàn)1個(gè)引物擴(kuò)增出1條雄性相關(guān)的特異性條帶,將該引物作為基礎(chǔ),向兩端延伸2-3個(gè)堿基,獲得了一個(gè)新的與雄性相關(guān)的SCAR標(biāo)記。
1.3SSR和ISSR分子標(biāo)記
簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR)和短串聯(lián)重復(fù)(STR)是一類由幾個(gè)堿基組成的基因序列串聯(lián)重復(fù)而形成的DNA序列,SSR標(biāo)記技術(shù)就是以這些長(zhǎng)度不同的片段在不同材料中的表現(xiàn)形式為基礎(chǔ),研究其與表型之間的關(guān)系。SSR分子標(biāo)記技術(shù)具有共顯性、高度重復(fù)性、高度多態(tài)性等優(yōu)點(diǎn),在工業(yè)大麻研究中通常用來(lái)構(gòu)建遺傳連鎖圖譜、群體遺傳多樣性分析和遺傳學(xué)研究、系譜分析和作為法醫(yī)鑒定工具。此外,為突破SSR標(biāo)記的一些限制性因素,將SSR序列兩端隨機(jī)添加2-4個(gè)核苷酸,形成簡(jiǎn)單重復(fù)序列間區(qū)(ISSR),ISSR的引物設(shè)計(jì)相對(duì)SSR則較為簡(jiǎn)單且更具專一性,在應(yīng)用方面更是兼具RAPD和SSR的優(yōu)點(diǎn)。
信朋飛等(2014)通過(guò)NCBI中大麻EST數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)計(jì)49對(duì)SSR引物,篩選出29對(duì)多態(tài)性引物,并選擇其中的7對(duì)引物對(duì)所研究的24份材料構(gòu)建了SSR指紋圖譜。張慶瀅等(2017)通過(guò)篩選出的9條ISSR引物對(duì)96個(gè)遼寧科爾沁沙地野生大麻自然群居個(gè)體進(jìn)行遺傳多樣性分析,最終確定樣本量在多于25個(gè)時(shí)可以較好代表該群體的遺傳多樣性水平。Marcello等(2021)從41個(gè)nSSR(nuclear SSR)標(biāo)記中篩選出20個(gè)高度多態(tài)性和鑒別位點(diǎn),對(duì)11個(gè)工業(yè)大麻品種的104個(gè)個(gè)體進(jìn)行了測(cè)試。選擇的標(biāo)記能夠成功地評(píng)估品種內(nèi)部和品種間的純合性、遺傳一致性和遺傳變異?;谛詣e表現(xiàn)(雌雄異株和雌雄同株)和地理起源,群體結(jié)構(gòu)分析確定了八個(gè)遺傳類群。張慶瀅等(2018)利用篩選出的19對(duì)EST-SSR引物構(gòu)建了30個(gè)工業(yè)大麻品種的指紋圖譜,這30個(gè)大麻品種包含22份野生型和8份栽培品種,共檢測(cè)到235個(gè)等位變異,被分成南、北兩個(gè)類群顯示出地域性分布,但親緣關(guān)系比較相近。Dufresnes(2017)利用13個(gè)STRs標(biāo)記將1324個(gè)樣本分為24個(gè)工業(yè)大麻品種和15個(gè)藥用型品種,可用于法醫(yī)學(xué)鑒定。
1.4AFLP分子標(biāo)記
AFLP是通過(guò)限制性內(nèi)切酶酶切基因組DNA后,所得片段的不同長(zhǎng)度檢測(cè)多態(tài)性的一種DNA指紋分析技術(shù),兼具RFLP標(biāo)記的可靠性和高效性的同時(shí),更加快速、靈敏、穩(wěn)定。目前,AFLP標(biāo)記技術(shù)主要在工業(yè)大麻的遺傳多樣性分析、品種分類和產(chǎn)地溯源、性別鑒定方面應(yīng)用較多。
胡尊紅等(2012)利用AFLP進(jìn)行的工業(yè)大麻品種多樣性分析表明,云南地區(qū)的群體遺傳多樣性水平較高,其次是黑龍江群體;四川和廣西群體遺傳一致程度最高;云南、貴州和四川群體一致程度趨于中間水平;甘肅和山西群體一致度最低,表明工業(yè)大麻遺傳變異較大。呂佳淑等(2010)選用64對(duì)AFLP引物對(duì)10個(gè)品種雌雄株混合的群體進(jìn)行篩選,在引物E-ACT/M-CTA擴(kuò)增結(jié)果中發(fā)現(xiàn)一條與工業(yè)大麻雄性植株相關(guān)的特異性條帶,可用于早期性別鑒定。郭麗等(2015)選用AFLP技術(shù)對(duì)11個(gè)品種雌雄株混合的群體進(jìn)行篩選,共得到6對(duì)多態(tài)性引物,并在引物E-ACA/M-CTG擴(kuò)增結(jié)果中發(fā)現(xiàn)一雄性相關(guān)特異性條帶,可用于早期性別鑒定。
2工業(yè)大麻全基因組關(guān)聯(lián)分析應(yīng)用進(jìn)展
GWAS是以連鎖不平衡為基礎(chǔ),在研究群體中利用一定數(shù)量的分子標(biāo)記進(jìn)行全基因組水平上的多態(tài)性分析,再與表型數(shù)據(jù)結(jié)合起來(lái)進(jìn)行研究的一種方法。GWAS的優(yōu)勢(shì)在于所用群體為富含基因資源的自然群體,分辨率高,研究周期短。隨著研究深入細(xì)化,GWAS在大麻中的應(yīng)用除了進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析,還用于重要農(nóng)藝性狀相關(guān)位點(diǎn)和候選基因的挖掘,如CBD和THC合成途徑、性別發(fā)育、纖維素品質(zhì)等相關(guān)基因的挖掘研究。
陳璇等(2018)對(duì)野生型和栽培型工業(yè)大麻進(jìn)行全基因組測(cè)序,檢測(cè)到226萬(wàn)多個(gè)SNP位點(diǎn),這兩個(gè)品種的雜合度分別為0.12%和0.11%,二等位多態(tài)性SNP分為4種類型,親本純合、雜合類型SNP分別占46.32%、53.47%,因此以當(dāng)前狀態(tài)下兩種類型品種即可構(gòu)建遺傳分離群體。
Van等(2011)對(duì)藥用大麻基因組DNA和RNA進(jìn)行測(cè)序,報(bào)告了一個(gè)534 Mb的單倍體基因組序列草圖和一個(gè)30000個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄組。通過(guò)對(duì)藥用型和工業(yè)用大麻品種轉(zhuǎn)錄組的比較發(fā)現(xiàn),藥用型大麻表達(dá)更多的編碼大麻素和前體蛋白的基因,藥用型大麻轉(zhuǎn)錄組中只有四氫大麻酸合成酶,而工業(yè)用大麻中的四氫大麻酸合成酶被大麻二酚酸合成酶取代了,以此表明THC是在藥用型大麻中生成的,而不是在工業(yè)大麻中。Gao等(2018)采用RNA-seq 技術(shù),研究了工業(yè)大麻在干旱脅迫下的轉(zhuǎn)錄組變化。共鑒定出差異表達(dá)基因1292個(gè),其中上調(diào)基因409個(gè)(31.66%),下調(diào)基因883個(gè)(68.34%),并用qRT-PCR方法對(duì)12個(gè)基因的表達(dá)模式進(jìn)行了驗(yàn)證,GO和KEGG分析顯示NAC、B3、過(guò)氧化物酶、膨脹素和肌醇加氧酶等可能在抗旱中起重要作用,11個(gè)KEGG途徑受到顯著影響,其中影響最大的是含有15個(gè)差異表達(dá)基因的植物激素/信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑。在干旱和ABA誘導(dǎo)條件下,脫落酸途徑相關(guān)基因的表達(dá)模式相似,說(shuō)明脫落酸在抗旱脅迫中起重要作用。Kaitlin等(2019)通過(guò)藥用大麻和工業(yè)大麻雜交得到的物理和遺傳圖譜地圖顯示,大麻素生物合成基因通常是不連鎖的,但是芳香烯基轉(zhuǎn)移酶(ap)為T(mén)HCA和CBDA合成酶提供底物,與已知的大麻素含量標(biāo)記緊密連鎖。Zhang等(2018)利用大麻基因組和轉(zhuǎn)錄組鑒定了不同大麻品種LBD基因家族,并分析其表達(dá)模式。結(jié)果顯示,大麻L(zhǎng)BD包含32個(gè)成員,分為兩大類,七個(gè)亞科,不均勻的分布在10條染色體上。該基因的上游啟動(dòng)子區(qū)含有多種與植物激素和環(huán)境因子有關(guān)的順式作用元件,不同品種(低四氫大麻酚、高大麻二醇)的莖、葉和花中的順式作用元件表達(dá)模式不同。Lbd基因家族成員主要表達(dá)在兩個(gè)品種的花和莖中,成員在葉片中表達(dá)極少,這些基因可能參與大麻的生長(zhǎng)和發(fā)育,并影響大麻素的生物合成。Ren等(2021)使用110個(gè)來(lái)自世界各地的大麻材料進(jìn)行全基因組重測(cè)序,證明了現(xiàn)在所有的工業(yè)型和藥用品種都是從一個(gè)祖先的基因庫(kù)中分離出來(lái)的,這個(gè)基因庫(kù)目前以中國(guó)的野生品種和地方品種為代表,分析了與工業(yè)型和藥用品種鑒別相關(guān)的候選基因,包括分枝模式和纖維素/木質(zhì)素生物合成,發(fā)現(xiàn)在選擇增加纖維產(chǎn)量或精神活性的過(guò)程中,參與大麻素合成的基因功能喪失。
Petit等(2020)采用全基因組關(guān)聯(lián)分析方法,對(duì)大麻開(kāi)花時(shí)間和性別決定的遺傳建成進(jìn)行研究。使用SNP標(biāo)記對(duì)123份大麻材料進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)8個(gè)QTLs,其中6個(gè)與開(kāi)花時(shí)間相關(guān)、兩個(gè)2個(gè)與性別相關(guān)。這些QTLs覆蓋了基因組區(qū)域,預(yù)測(cè)有33個(gè)轉(zhuǎn)錄本參與開(kāi)花和性別決定。在開(kāi)花時(shí)間性狀的QTLs中發(fā)現(xiàn)了與光感知和轉(zhuǎn)錄相關(guān)的基因,以及調(diào)控開(kāi)花的轉(zhuǎn)錄因子。在性別決定的QTLs中發(fā)現(xiàn)了轉(zhuǎn)錄因子和調(diào)節(jié)植物激素(特別是生長(zhǎng)素和赤霉酸)平衡的基因。同年,Petit等(2020)利用相同的群體材料,研究了與纖維品質(zhì)相關(guān)的7個(gè)細(xì)胞壁性狀和韌皮纖維性狀的遺傳基礎(chǔ)。使用RAD-seq對(duì)大麻纖維板進(jìn)行基因分型,SNP標(biāo)記進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),對(duì)不同纖維品質(zhì)性狀的16個(gè)QTL進(jìn)行了定位,包括葡萄糖、葡萄糖醛酸、甘露糖、木糖、木質(zhì)素和韌皮纖維含量,以及12個(gè)候選基因,它們可能參與了單糖、多糖和木質(zhì)素的生物合成和修飾,在大麻纖維品質(zhì)的決定中起著重要作用。Hua等(2022)在工業(yè)大麻全基因組水平鑒定了WRKY基因家族中39個(gè)CasWRKYs,分析了它們的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、染色體位置、順式作用元件、基因結(jié)構(gòu)、保守序列和表達(dá)模式。根據(jù)基因結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)發(fā)育分析,將CasWRKY蛋白分為3個(gè)群和7個(gè)亞群,CasWRKY啟動(dòng)子區(qū)的調(diào)控因子含有多種順式調(diào)控元件,其中P-box順式調(diào)控元件的頻率較高,說(shuō)明CasWRKY對(duì)赤霉素的調(diào)控具有一定的反應(yīng)性。又通過(guò)RNA-seq和qRT-PCR表達(dá)譜分析發(fā)現(xiàn),13個(gè)CasWRKY基因?qū)A3脅迫作出反應(yīng),影響纖維發(fā)育,并在莖生長(zhǎng)和發(fā)育中發(fā)揮重要作用。
3大麻特異性標(biāo)記開(kāi)發(fā)研究進(jìn)展
針對(duì)特定的研究需要,學(xué)者們根據(jù)相應(yīng)的基因組區(qū)域或者CBD和THC相關(guān)基因序列,開(kāi)發(fā)出一系列特異性標(biāo)記用來(lái)鑒定群體特征和CBD及THC的合成規(guī)律,這些標(biāo)記的開(kāi)發(fā)和使用成本比較低廉,且檢測(cè)手段簡(jiǎn)單、快速、靶向性強(qiáng),結(jié)果穩(wěn)定可靠、重復(fù)性好。
Zhang等(2018)在葉綠體5個(gè)高頻突變區(qū)間,開(kāi)發(fā)了5個(gè)特異性標(biāo)記,對(duì)52份大麻樣品(25個(gè)野生種群和27個(gè)栽培種群)中的645個(gè)個(gè)體進(jìn)行了單倍群的鑒定,發(fā)現(xiàn)這3個(gè)單倍群具有明顯的高、中、低緯度梯度分布格局,首次揭示了低緯度單倍群是最早的分支,這意味著大麻可能起源于低緯度地區(qū)。
陳璇等(2016)根據(jù)THCAS和CBDAS基因多態(tài)性,設(shè)計(jì)了一個(gè)共顯性復(fù)合PCR分子標(biāo)記,通過(guò)對(duì)我國(guó)不同來(lái)源地的23份大麻種質(zhì)資源共69個(gè)單株材料中THC和CBD含量特征及其關(guān)鍵合成酶基因多態(tài)性進(jìn)行分析,鑒定了我國(guó)大麻種質(zhì)資源的大麻素化學(xué)型及基因型。Garfinkel(2021)利用兩個(gè)雜交群體,一個(gè)是CBGA優(yōu)勢(shì)品種與THCA優(yōu)勢(shì)品種之間的雜交群體,另一個(gè)是CBGA優(yōu)勢(shì)品種與CBDA優(yōu)勢(shì)品種之間的雜交群體,進(jìn)行THCA合成酶基因的等位基因分析,最終發(fā)現(xiàn)一個(gè)SNP可能使合成酶無(wú)法將CBGA轉(zhuǎn)換為T(mén)HCA,從而導(dǎo)致CBGA的積累。Flavia等(2021)對(duì)一組基因型代表所有歐洲大麻化學(xué)類型的品種,開(kāi)發(fā)高度特異性的引物以精確區(qū)分不同的大麻素合酶基因,除了作為檢測(cè)基因組水平上CBCAS存在的標(biāo)記,還可以分析大麻的轉(zhuǎn)錄譜。研究表明,雖然THCAS和CBDAS的高轉(zhuǎn)錄水平清楚地反映了植物的化學(xué)表型,但CBCAS在所有基因型中的低但穩(wěn)定的轉(zhuǎn)錄水平表明這些基因是活躍的,可能對(duì)最終的大麻素含量有貢獻(xiàn)。
4展望
隨著分子標(biāo)記技術(shù)的不斷優(yōu)化、改良、創(chuàng)新,其解決科學(xué)問(wèn)題的所屬領(lǐng)域也不斷擴(kuò)大、加深。由最開(kāi)始的構(gòu)建遺傳連鎖圖譜到鑒別品種類型、測(cè)定品系純度,再到種質(zhì)資源的遺傳多樣性分析、指紋圖譜構(gòu)建、農(nóng)藝表型相關(guān)的候選基因挖掘、各種代謝通路相關(guān)基因的表達(dá)分析等,分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用使育種家多年以來(lái)繁瑣的育種工作日益便捷。
在工業(yè)大麻研究中,研究學(xué)者比較關(guān)注的三個(gè)領(lǐng)域分別為法醫(yī)學(xué)、醫(yī)藥學(xué)和遺傳育種學(xué),即品種類型(藥用型和工業(yè)用型)、藥用成分含量、植株性別決定因素以及纖維素的品質(zhì)和含量。通過(guò)分子標(biāo)記技術(shù)的應(yīng)用,一些與農(nóng)藝表型和生理生化特征相關(guān)的特異性標(biāo)記和候選基因相繼被發(fā)掘,為不同領(lǐng)域的鑒別和分析工作奠定了堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ),此外,候選基因的發(fā)掘不僅可以在分子水平闡明各種代謝途徑的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、拓展野生品種和栽培品種的遺傳基礎(chǔ),還可以突破現(xiàn)有種質(zhì)資源瓶頸、使工業(yè)大麻種質(zhì)創(chuàng)新成為可能。
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文章摘自:趙曦,王玉杰,王家有,李曉娟,冷春旭,趙偉,王貴江,胡少新,張利國(guó),王珣.分子標(biāo)記技術(shù)在工業(yè)大麻研究中的應(yīng)用進(jìn)展[J/OL].分子植物育種:1-7[2022-07-08].http://kns.cnki.net/kcms/detail/46.1068.S.20220602.1555.008.html
